MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli W plasmid pRK1

Total Repeats: 438

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017665	CAA	2	6	1422	1427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017665	CAG	2	6	1453	1458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017665	CT	3	6	1934	1939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017665	CCG	2	6	1940	1945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017665	CTAT	2	8	1981	1988	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017665	GGC	2	6	2293	2298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017665	AGG	2	6	2322	2327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017665	T	6	6	3255	3260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017665	CAG	2	6	3263	3268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017665	GAGCA	2	10	3269	3278	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017665	AGC	2	6	3279	3284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017665	A	6	6	3746	3751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017665	TTTAT	2	10	3758	3767	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017665	ATAA	2	8	3792	3799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017665	A	6	6	3804	3809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017665	GAA	2	6	3812	3817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017665	T	7	7	3825	3831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017665	GTG	2	6	3877	3882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017665	ACC	2	6	3891	3896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017665	TTG	2	6	3905	3910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017665	CGT	2	6	3914	3919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017665	TTC	2	6	3922	3927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017665	GCG	2	6	3941	3946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017665	GT	3	6	3965	3970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017665	GCC	2	6	4013	4018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017665	G	6	6	4053	4058	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017665	TACA	2	8	4059	4066	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017665	GTC	2	6	4085	4090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017665	GA	3	6	4096	4101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017665	GTG	2	6	4176	4181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017665	CTC	2	6	4250	4255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017665	GAG	2	6	4293	4298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017665	T	8	8	5190	5197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017665	ATC	2	6	5203	5208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017665	ATG	2	6	5222	5227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017665	TC	3	6	5585	5590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017665	ATC	2	6	5615	5620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017665	AACT	2	8	5624	5631	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017665	ATG	2	6	5674	5679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017665	ATTT	2	8	13517	13524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017665	GTT	2	6	13571	13576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017665	ATT	2	6	13589	13594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017665	CAG	2	6	13649	13654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017665	TAT	2	6	13671	13676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017665	TCT	2	6	13696	13701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017665	ACT	2	6	13705	13710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017665	ATA	2	6	14652	14657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017665	AGTT	2	8	14702	14709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017665	TTG	2	6	14758	14763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017665	GCGG	2	8	14790	14797	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017665	TGGT	2	8	14851	14858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017665	A	7	7	14929	14935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017665	T	7	7	14953	14959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017665	AGT	2	6	15067	15072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017665	GGT	2	6	15147	15152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017665	GCT	2	6	15153	15158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017665	T	7	7	15611	15617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017665	TAAT	2	8	15635	15642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017665	AATG	2	8	15662	15669	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017665	ATT	2	6	15734	15739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017665	AT	3	6	15753	15758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017665	TTG	2	6	15809	15814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017665	TGT	2	6	16018	16023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017665	CAAA	2	8	16026	16033	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017665	GCT	2	6	16065	16070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017665	TA	3	6	16690	16695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017665	TC	3	6	16727	16732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017665	AT	3	6	16752	16757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017665	CA	3	6	18970	18975	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017665	TTAA	2	8	18980	18987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017665	AGG	2	6	24494	24499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017665	T	7	7	24518	24524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017665	GAA	2	6	24551	24556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017665	CCT	2	6	25538	25543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017665	AT	3	6	26018	26023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017665	A	7	7	26044	26050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017665	A	6	6	34404	34409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017665	A	7	7	34415	34421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017665	CCG	2	6	34425	34430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017665	G	6	6	34447	34452	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017665	CCAGT	2	10	35055	35064	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_017665	GTG	2	6	35068	35073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017665	TGG	2	6	35082	35087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017665	ACC	2	6	35092	35097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017665	GAC	2	6	35101	35106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017665	ACAG	2	8	37800	37807	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017665	GAT	2	6	37808	37813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017665	GTTT	2	8	37814	37821	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017665	AAAT	2	8	37844	37851	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017665	ATT	2	6	37895	37900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017665	CTGG	2	8	37908	37915	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017665	GTC	2	6	37923	37928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017665	ATG	2	6	37982	37987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017665	CGA	2	6	37995	38000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017665	ATA	3	9	38746	38754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017665	AAC	2	6	40022	40027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017665	T	6	6	40051	40056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017665	TCC	2	6	40905	40910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017665	T	6	6	40957	40962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017665	AAT	2	6	40974	40979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017665	GTT	2	6	41011	41016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017665	ATG	2	6	41045	41050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017665	TGC	2	6	41063	41068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017665	GGC	2	6	41165	41170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017665	TCG	2	6	41176	41181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017665	ATCAC	2	10	47077	47086	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_017665	AT	3	6	50499	50504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017665	ATG	2	6	50978	50983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017665	TCT	2	6	51167	51172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017665	TAA	2	6	51180	51185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017665	TGCC	2	8	51204	51211	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017665	GTA	2	6	51636	51641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017665	ACTG	2	8	51654	51661	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017665	TTG	2	6	51750	51755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017665	GCTGT	2	10	51786	51795	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017665	ATT	2	6	51833	51838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017665	GTT	2	6	51855	51860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017665	CAA	2	6	51903	51908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017665	GCC	2	6	51946	51951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_017665	AAT	2	6	51974	51979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017665	T	8	8	52004	52011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017665	TA	3	6	52034	52039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017665	GTTA	2	8	52047	52054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017665	TAAG	2	8	52065	52072	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017665	ATT	2	6	52078	52083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017665	GA	3	6	52120	52125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017665	TTG	2	6	52183	52188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017665	ATT	2	6	52201	52206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017665	T	6	6	52284	52289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017665	T	6	6	52339	52344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017665	TGGTG	2	10	52348	52357	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017665	GAC	2	6	52376	52381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017665	TCCG	2	8	52388	52395	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017665	AT	3	6	52430	52435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017665	TAA	2	6	52483	52488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017665	TTTA	2	8	52529	52536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017665	TCA	2	6	52578	52583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017665	TTA	2	6	52584	52589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017665	GT	3	6	52651	52656	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017665	TCT	2	6	52702	52707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017665	AAG	2	6	52751	52756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017665	AGT	2	6	52770	52775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017665	ACC	2	6	52794	52799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_017665	TTA	2	6	52923	52928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017665	AAT	2	6	52954	52959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017665	CAG	2	6	52971	52976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017665	ATT	2	6	52990	52995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017665	GTTG	2	8	53006	53013	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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437	NC_017665	GTG	2	6	102426	102431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
438	NC_017665	GAA	2	6	102474	102479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.